胡凱將EDTA遞給江凡的時候,江凡忽然問道,「除了抑制核酸酶活性,你還知道它有什麼作用嗎?」
胡凱愣了愣,認真想了想,「能避免微量痕量DNA的降解?」
江凡點了點頭,露出一副孺子可教的模樣,這可把胡凱整不會了。
但就目前來看,這個年輕人好像還真的有什麼方法,可以配比出那個什麼非破壞性溫和浸泡液體。
真是這樣的話,嘶.......
這不禁越發讓他期待起來。
「0.05%體積占比的低濃度Tween-20。」江凡快速說道。
接過胡凱調配好的溶液後,江凡看著他,笑了一下,解釋道。
「這相當於是一種溫和非離子去垢劑,可以高效裂解細胞釋放核酸,不會破壞布料纖維素結構、造成織物褪色或縫線損傷。」
胡凱睜大雙眼,感覺知識進入自己的大腦,還沒接受完呢,又聽見江凡說。
「0.1mg/mL的低活性蛋白酶K,快點!」
「哦哦哦。」回過神來的胡凱屁顛屁顛地去工具台那裡配製。
江凡接過後,在胡凱的注視下,小心翼翼地用0.22μm濾膜,將特製的液體過濾除菌。
完事後,江凡還回頭看了胡凱一眼,「這樣做的目的是,既保證了痕量細胞的裂解與DNA釋放效率,又從根本上避免了對檢材造成任何不可逆的損傷。」
此時的胡凱早就沒有了當時的自信,而像是在課堂上的學生,手裡拿著紙筆,不斷記錄著。
接下來到了最關鍵的一步,能不能在布娃娃身上提取出第三個人的生物檢材,就靠這一步了!
江凡用移液槍吸取剛配製好的溫和裂解緩衝液,精準地滴在娃娃左耳咬痕處、領口、手臂接縫等目標區域。
並且嚴格控制緩衝液的用量,讓液體剛好浸潤布料表層的纖維,卻不會滲透進內部的棉絮填充物。
這樣的話,不會造成布料褪色、縫線鬆脫。
隨後她將布娃娃平穩放入恆溫孵育箱,在嚴格控制的溫度和濕度下進行溫和洗脫。
忙完這步後,江凡才轉過頭對胡凱說道。
「這種緩衝液不會破壞布料的纖維結構,只會通過溫和的去垢作用,讓附著在織物纖維縫隙里的細胞自然脫落。
同時釋放出細胞內的DNA分子,全程不會對物證本身造成任何可觀測的損傷。」
胡凱頭點得跟小雞啄米一般,同時手裡在記著,嘴裡還問道:「嗯嗯,要孵化多久才合適點呢?」
江凡想了想,「兩個小時吧。」
......
兩個小時後,胡凱看著自己寫了整整兩個小時的東西,然後輕輕地搖了搖趴在桌上睡著了的江凡。
「江顧問...江顧問...時間到了。」
被吵醒的江凡眨巴了一下迷糊的眼睛,雙眼猩紅,這幾天幾夜,他幾乎沒怎麼睡過覺。
所以才在等待的兩個小時裡打了個盹。
江凡把布娃娃從孵育箱中取出,用無菌濾紙輕輕吸走表面殘留的緩衝液,放在無菌操作台上自然晾乾。
原本洗得發白的布娃娃沒有任何破損、褪色、變形,連原本磨毛的衣角都和剛拿回來的時候一模一樣。
只需要晾乾後就能原樣送回謝曉楠,江凡可沒忘記,自己對她的承諾。
而他手中這份只有幾毫升的洗脫液里,已經很有可能藏著這樁27年懸案的密碼!
他看向一臉認真的胡凱,「下來就是進行提純了。」
隨後江凡用超順磁性磁珠法,對洗脫液進行純化,精準剔除掉溶液里的布料纖維、染料、蛋白雜質以及會干擾後續實驗的PCR抑制劑。
最終得到了幾十微升高純度、但總量極其微量的基因組DNA。
但現在擺在江凡面前的,還有一個難題——
對這些微量DNA的質量把控。
二十年的時光早已讓大部分DNA片段降解成了碎片。
常規的螢光定量PCR只能給出相對模糊的定量結果,根本無法準確判斷樣本里到底有多少能用於測序的完整DNA片段。
一旦貿然測序,極有可能因為模板質量不足,得到一堆無用的亂碼數據。
最後江凡選擇了微滴式數字PCR(ddPCR)進行樣本質控,這倒不是什麼超前科技,而是目前微量降解DNA定量與質量評估的金標準。
不同於常規PCR只能在反應結束後給出相對定量結果,ddPCR會先將反應體系通過微流控技術,拆分成兩萬多個完全獨立的皮升級水包油微滴。
每個微滴都是一個互不干擾的微型PCR反應器。
哪怕樣本里只有幾個完整的目標DNA分子,都會被分散在不同的微滴里,被精準擴增、計數,最終實現絕對定量。
同時還能準確檢測DNA的完整度和抑制劑殘留情況,徹底避免了常規PCR受擴增效率影響的定量偏差。
四十分鐘後,ddPCR的檢測結果出現在屏幕上。
江凡和胡凱死死盯著那清晰的陽性微滴分群圖、精準的絕對定量數值,懸了一夜的心終於穩穩落了地。
因為樣本中可用於測序的完整人類DNA片段總量、片段完整度均完全滿足實驗要求,沒有檢測到PCR抑制劑殘留。
這一步,成了!
「接下來的核心步驟,是雜交捕獲富集高通量測序(NGS)。」
江凡剛說完,忽然就聽見胡凱說,「江顧問,下來的我來吧,你說我做就行了。」
江凡愣了愣,隨即釋然笑了,「好!」
這些技術是前幾年研發出來,面前這位全省檢驗的扛把子,肯定是手拿把掐。
這個布娃娃上的DNA,不僅總量極低,還混雜了大量的干擾序列:
大部分是當年接觸過布娃娃的辦案人員的污染DNA、環境裡的微生物基因組。
真正屬於周立偉的目標DNA,占比不到千分之一。
如果直接做常規全基因組測序,就像對著一片長滿雜草的荒原盲掃,99%以上的測序數據都是無用的干擾信息。
嫌疑人的基因信號會被徹底淹沒在背景噪音里,根本無法識別。
而雜交捕獲富集技術,就是為了解決這個難題而生的。
胡凱使用的法醫專用捕獲試劑盒裡,帶有數十萬條和人類基因組中用於個體識別的核心SNP位點、STR位點完全互補的核酸探針......
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