嘉靖三十九年五月，廣東南澳島。
南澳，位於廣東潮州府東南，閩粵交界處的茫茫大海之中。全島東西長四十餘里，南北寬二十餘里，主峰高聳入雲，島上林木茂密，溪澗縱橫。島的北面與大陸之間隔著一條十餘里寬的海峽，海峽中暗礁密布，水流湍急，不熟悉航路者根本不敢行船。島的南面則是茫茫大洋，水深浪急，直通呂宋、暹羅諸國。
自吳平占據南澳以來，這座原本荒僻的海島，變成了一座規模龐大的海盜巢穴。
吳平在島上經營數年，將主峰南面的海灣建成了天然良港。港灣入口狹窄，僅容兩船並行，兩側懸崖峭壁，易守難攻。港灣內可泊船數百艘，水深數丈，避風條件極佳。吳平在港灣兩側的崖壁上修築了炮台，架設從佛郎機人手中購得的火炮二十餘門，火力可覆蓋整個港灣入口。又在港灣深處修建了船塢與倉庫，囤積糧草、兵器、火藥，足以支撐數年之用。
島中央的主峰半腰，吳平建了一座大寨，名曰「金城」。金城依山而建，石牆高兩丈余，厚五尺，牆上設垛口與箭樓，四角各有一座碉樓。金城之內，有議事廳、糧倉、軍器庫、銀庫、囚牢，還有吳平的「王府」。吳平自稱「南澳王」，在島上設官分職，封了左右丞相、大將軍、都督等官號，儼然一個小朝廷。
從嘉靖三十五年到三十九年，吳平以南澳為基地，率船隊縱橫閩粵沿海，劫掠商船，攻打州縣，殺掠百姓數以萬計。他不僅與廣東沿海的倭寇勾結，還暗中與日本平戶的王直保持聯絡，成為東南海上最後一支大規模的海盜武裝。
然而嘉靖三十九年夏，吳平的末日終於來臨。
俞大猷率廣東水師八十艘戰船，自潮州港出發，直撲南澳。船隊行至海峽入口時，俞大猷命水師暫停前進，召集諸將做最後的部署。
俞大猷站在旗艦的船頭，指著南澳島對諸將道：「吳平在島上經營數年，港灣入口有炮台封鎖，正面強攻傷亡必大。我軍雖眾，然島上的地理形勢，吳平比我軍熟悉。若貿然進攻，正中其下懷。」
廣東總兵劉顯問道：「大帥之意，當如何破敵？」
俞大猷展開一幅南澳島的輿圖，這是他在備戰期間命斥候多次潛入偵察後繪製的。輿圖上詳細標註了港灣入口的炮台位置、金城的防禦布局、島上的水源與糧倉所在。
「吳平的海盜船雖多，然其巢穴的弱點在於水源。」俞大猷指著輿圖上的幾處溪澗，「南澳島雖大，可飲用的淡水只有三處：一是金城旁的龍潭，二是東面的赤石灣，三是西面的雲澳。吳平在龍潭與赤石灣都設了守衛，唯獨雲澳因遠離金城，只派了百餘人看守。我軍若先奪取雲澳，斷其西路水源，則吳平必然分兵來救。待其分兵，我便以主力從正面強攻港灣入口。」
劉顯點頭道：「聲東擊西，調虎離山。」
俞大猷道：「正是。此外，吳平此人狡詐，若見大勢已去，必然從海上逃走。因此我軍不僅要破其巢穴，更要斷其逃路。劉總兵，你率陸師三千，乘小船趁夜在島的東面與西面同時登陸，從陸上切斷吳平向東、向西的退路。我自率水師主力，在港灣入口外列陣，待陸上打響，便以佛郎機炮轟擊港內，掩護水師沖入港灣。」
他頓了一下，目光掃過諸將，沉聲道：「此戰，不僅要破南澳，更要擒吳平。若讓他逃入外洋，日後必成後患。諸將務必奮勇向前，不可懈怠！」
諸將齊聲應諾。
嘉靖三十九年五月初八夜，俞大猷發起總攻。
劉顯率陸師三千人，分乘數十艘小船，藉著夜色與海霧的掩護，分別在南澳島東面的赤石灣與西面的雲澳登陸。登陸出乎意料地順利——雲澳的守軍不過百餘人，被明軍一個衝鋒便擊潰；赤石灣的守軍稍多，卻也抵擋不住劉顯麾下鴛鴦陣的攻勢，不到半個時辰便被全殲。
兩處登陸成功後，劉顯立即分兵：一路由參將王麟率領，直插金城東側，切斷吳平向東逃竄之路；一路由劉顯親自率領，攻占龍潭水源，斷其飲水；自己率主力向西，與俞大猷的水師主力形成夾擊之勢。
與此同時，俞大猷的水師戰船在港灣入口外一字排開。佛郎機炮對準港灣兩側的倭寇炮台，轟然開火。炮聲震天，鐵彈呼嘯，港灣入口的崖壁上碎石紛飛，倭寇的炮台被逐一摧毀。倭寇倉促還擊，但他們的火炮數量少，射程近，很快便被明軍壓制。
炮擊持續了半個時辰，港灣入口的倭寇炮台盡數被毀。俞大猷一聲令下，水師戰船魚貫沖入港灣。
港灣內，吳平的海盜船早已亂成一團。有的船來不及起錨便被明軍炮火擊沉；有的船慌忙升帆企圖衝出港灣，卻在狹窄的入口處與友船相撞，擠成一團；還有的船直接擱淺在岸邊，船上的海盜棄船登岸，四散奔逃。
俞大猷的水師沖入港灣後，如虎入羊群，佛郎機炮與火繩槍齊發，將海盜船一艘艘擊沉。港灣內火光沖天，濃煙蔽日，海盜船的殘骸與屍體漂浮在水面上，將整個港灣染成了赤紅色。
吳平在金城中得知明軍已破港灣入口，劉顯的陸師又已切斷東西兩路退路，知道大勢已去。他急命左右丞相率殘部據守金城，自己則帶著數十名親信與數箱金銀珠寶，從金城後山的一條秘密小道逃往島的南面。
然而俞大猷早已料到他會從南面逃竄。他命水師分出二十艘快船，繞到島的南面，在吳平可能出逃的海灣外守候。
吳平帶著親信逃到南面海灣時，天色已明。他遠遠望見海面上有幾艘明軍快船在游弋，知道南面的海路已被封鎖。他不敢停留，轉身向東面的密林中逃去。然而劉顯的陸師已從東面包抄過來，吳平又折向西面。西面的雲澳已被明軍占領，吳平走投無路，最終被圍困在島中央的一處山谷之中。
五月九日，明軍對吳平的殘部發起最後的圍剿。
劉顯率陸師從三面壓向山谷，俞大猷的水師也從海上派來數百名火繩槍手，從南面登陸，加入圍剿。山谷中的海盜殘部約數百人，在明軍的四面包圍下拼死抵抗。吳平親自揮刀督戰，連斬數名退縮的部下，卻依然擋不住明軍的攻勢。鴛鴦陣在山谷中步步推進，將海盜殘部逐一分割殲滅。
戰至午後，海盜殘部死傷殆盡，吳平身邊只剩下十餘人。他見大勢已去，長嘆一聲，將手中寶刀擲於地上，對身旁的親通道：「我吳平縱橫海上二十年，今日死在這裡，也算不枉此生。你們各自逃命去吧。」
親信們不忍離去，吳平怒道：「走！再不走，一個也活不了！」
親信們含淚散去。吳平獨自坐在一塊大石上，從懷中取出一壺酒，仰頭灌了幾口。然後將酒壺一扔，拔出腰間短刀，便要自刎。
就在這時，一陣腳步聲從四面八方傳來。劉顯率數十名明軍士卒從山谷兩側衝下，將吳平團團圍住。劉顯高聲道：「吳平！你已無路可逃！放下兵器，饒你不死！」
吳平抬頭看了劉顯一眼，忽然笑了。那笑聲在山谷中迴蕩，帶著幾分淒涼與自嘲。他將短刀往地上一插，站起身來，攤開雙手：「罷了。我隨你們走。」
吳平被擒後，南澳島上的抵抗迅速瓦解。金城被明軍攻破，吳平任命的左右丞相、大將軍等或死或降，島上數千海盜及其家屬被明軍俘虜。南澳島上的糧倉、軍器庫、銀庫盡數被明軍繳獲，其中光是白銀便有數十萬兩，糧草可供萬人食用三年，佛郎機炮三十餘門，火繩槍數百支，火藥數千斤。
五月十五日，俞大猷率水師凱旋，返回潮州。吳平被押解至廣州，廣東巡撫親自審訊。吳平對所犯罪行供認不諱，被判處凌遲。臨刑前，吳平對監斬官說：「我縱橫海上二十年，今日死在俞大猷手裡，不冤。只是可惜，我未能親眼看到王直的下場。」
南澳蕩平的訊息傳到北京，朝野震動。世宗在西苑聞報，難得地露出了笑容。他當即下旨：俞大猷加右都督，賜蟒袍玉帶，蔭一子錦衣衛百戶。廣東有功將士各有升賞。同時下旨：南澳島設南澳鎮，駐水師三千，由廣東總兵節制，永為海防重鎮。
然而俞大猷深知，吳平雖平，東南的海上威脅並未完全消除。王直仍盤踞日本平戶，麾下仍有海船數百艘、部眾數萬。吳平不過是王直在廣東的一支偏師，真正的勁敵尚未出動。
他在給戚繼光的信中寫道：「南澳既平，廣東倭患暫息。然王直未除，海上終無寧日。望戚將軍在福建繼續進剿，我在廣東整頓海防，待時機成熟，當合力進剿王直。」
戚繼光回信：「俞將軍放心。福建倭寇，我已次第掃平。待我盪清福建，便與將軍會師海上，共擒王直。」
嘉靖三十九年秋，戚繼光在福建先後攻破倭寇在福清、興化、泉州等地的巢穴，福建倭患基本平定。與此同時，俞大猷在廣東整頓水師，修築墩台，訓練鄉兵，將廣東沿海的防禦體系重新建立起來。兩位抗倭名將，一南一北，遙相呼應，將東南沿海的倭患逐一掃除。
南澳島的港灣中，被擊沉的海盜船殘骸漸漸沉入海底，被海水沖刷得乾乾淨淨。島上的金城廢墟上，野草在石縫中頑強地生長。但每年五月，總有廣東漁民在南澳附近的海面上，看見一群群白色的海鷗從島的上空飛過。漁民們說，那是吳平麾下戰死的海盜魂靈，化作了海鷗，永遠在南澳的上空盤旋。
而俞大猷的名字，從此與南澳緊緊聯絡在了一起。南澳鎮的城頭上，豎著一面大旗，旗上繡著「俞」字，在南海的季風中獵獵作響。那面旗幟，是廣東百姓自發繡制的。旗上的每一針每一線，都凝聚著他們對俞大猷的感激與敬仰。
南澳蕩平，是嘉靖朝東南抗倭戰爭的收官之戰。此戰之後，東南沿海的大規模倭患基本平息。雖然王直尚未擒獲，雖然零星的倭寇仍在沿海出沒，但東南的海疆，終於迎來了久違的安寧。而這份安寧，是俞大猷、戚繼光、湯克寬、劉顯以及無數將士用血與命換來的。
南澳的海風依舊吹拂，潮起潮落，無聲訴說著那段鐵血往事。而俞大猷站在潮州城頭，遙望南方海面時，心中已在籌劃著名最後一戰——擒王直，平台灣，開海禁，通商路。他知道，倭患的根源在於海禁。要徹底消除倭患，必須開海通商，讓百姓有活路，讓海商有出路。這個想法，他在心中醞釀已久，只待時機成熟，便要上疏朝廷，力陳開海之利。
南澳蕩平，不過是一個開始。東南的海疆，即將迎來一場更深遠的變革。而俞大猷，正是這場變革的先行者。