攻占揚州後，稍事休整，多鐸即率部渡過長江，克京口鎮江，直逼南京城下。
天突然下起了滂沱大雨，多鐸透過窗戶往外看著道：「這地方果跟咱們家鄉不同，繁華又富庶，唉，只不知咱們的勸降計劃能否成功？」
洪承疇信心十足地道：「洪某早在攻占揚州之前，就分別給他們寫了信，他們雖然沒有給回信，但對信使並沒有跟過去那樣聲色俱厲地斥責，這說明他們的態度還是有所轉變的。
如今，他們的皇上已經先逃了，咱們又兵臨城下，前面還有揚州之鑑，以洪某對他們的了解，他們雖不會甘心臣服，但為了百姓，應該還是會選擇歸降的。」
多鐸道：「但願吧，若是他們實在不識趣兒，咱就再給他來一個『南京十日』。」
洪承疇不由自主地打了個冷戰，頗有點兒討好意味地笑道：「王爺的另一手準備恐怕要用不上了。」
多鐸從招降中嘗到了甜頭，自然也不想輕易開戰，聞言，「哦」了一聲，極感興趣地道：「正好閒來無事，不妨說來聽聽。」
洪承疇沉思著道：「王爺尚未南下時，攝政王就曾派承疇秘密南下，見過錢謙益。
錢謙益的妻子柳如是對承疇橫眉冷對，錢謙益雖也不是很熱情，卻也沒有把承疇來訪的事兒張揚出去，還親自送承疇北返，而且承疇覺得他並不堅決反對承疇的觀點。
這次，承疇又給幾乎所有的熟人寫了信，除了錢謙益、趙之龍、王鐸三個沒有回信外，其他人居然都回了信。
承疇以為，他們也不會無動於衷的，或許此時他們正商量著怎麼歸降呢。」
其次，本王還要於揚州立史可法祠，表彰史可法的忠節，同時還要去報恩寺上香，拜謁明孝陵，禮遇前朝皇族。
當然了，本王也要告訴他們，若抗拒不降，揚州屠城便是前車之鑑。」
洪承疇稍稍放了心，道：「南京乃偽明的都城，占領並穩定之還只是第一步，更重要的是要迅速地控制江南。」
多鐸猛地拍了一下額頭，道了聲「提醒的是」，快步走至地圖前看著，半晌才又道：「一旦進入南京，當即命諸將向江南各地推進。可是，咋個推進法呢？」
洪承疇跟過來，順著他的目光轉動著，已聽他又道：「不妨兵分三路，一路由各路降將負責，分道招降南京周邊郡縣，李成棟去浙北、劉澤清去蘇南、劉良佐去皖南等；
再一路，由尼堪、耿仲明等率領八旗軍五千人和耿軍、沈軍（續順公沈志祥）全部合計水陸大軍一萬五千多人，在劉良佐配合下迅速搶占九江、安慶；
三一路，由博洛、孔有德等率領八旗軍七千人和耿軍全部合計兩萬人，先行追擊逃亡的明安宗。
本王則坐鎮南京，完成穩定南京的大任，並隨時準備支援另外的三路大軍。」
說完，自得地看了看洪承疇。
洪承疇稍頓了頓，道：「王爺所慮已甚為周全，如此的話，江浙可定，承疇認為，到那時，可奏請皇上和攝政王，改南京為江南省。
而後，以南京為中心，各重鎮要道派駐八旗重兵，雄視贛、閩、湘、粵、桂等省，隨時準備繼續南下，掃蕩各地的抗清武裝和明朝殘餘勢力。」
多鐸好奇地看著洪承疇，直到把洪承疇看得不好意思，才噗嗤一笑，輕輕拍了拍洪承疇的肩膀，道：「怪不得皇上和攝政王都看重洪公，洪公果然高瞻遠矚。」
洪承疇待要謙遜一番，中軍匆匆進來道：「啟稟王爺，偽明忻城伯趙之龍、大學士王鐸、禮部尚書錢謙益等，出城請降，希望大軍進城後勿傷百姓。」
多鐸一愣，看了看洪承疇，問道：「當真？就這樣冒著雨？」
中軍道：「正是。」
多鐸道：「好，走，隨本王前去受降。」說著，已往外走。
把左夢庚等趕進九江後，黃得功原準備來日即乘勝進兵，收降左夢庚殘部。不料，左夢庚竟帶了一部分人，連夜向阿濟格部投降，餘部被李自成手下大將白旺部招降。
沒辦法，黃得功只得收兵駐防蕪湖。剛進蕪湖，揚州和南京相繼失陷的訊息就傳了過來，黃得功大驚道：「皇上可安好？」
總兵翁之琪道：「聽說在他們獻城之前，皇上就已經出走了，沒人知道皇上現在在哪兒？」
黃得功頓腳道：「皇上可是咱們反清復明的依靠，若是沒有了皇上，原就亂成一團的反清勢力必將分崩離析，快，從速安排人去尋，務要保證皇上的安全。」
翁之琪道：「靖國公所言甚是，末將這就命人去尋。」
這時，中軍匆匆引了幾個人進來，道：「啟稟靖國公，這人說是您的親戚，有十萬火急的事兒找您，屬下不敢耽擱，直接帶他過來了。」
黃得功一愣，抬頭去看，居然是弘光帝朱由崧和皇太后鄒氏等家眷，忙跪倒行禮道：「您怎麼一個人來了？」
朱由崧泄氣道：「一路輾轉，跟馬愛卿等失散了，朕只得一個人到你這兒來了。」
說著，扶起黃得功，自去坐了。
黃得功道：「皇上如果死死地把守南京，我們還能夠盡力抵抗，為什麼聽信奸賊的話，匆匆忙忙來到這裡?況且我正在對敵作戰，怎麼能夠保護您的車駕?」
朱由崧道：「除了愛卿，朕已無可依靠了。」
黃得功心中感動，流淚道：「皇上但請放心，得功誓死捍衛皇上。」
話音剛落，一探馬匆匆來報：「啟稟靖國公，叛將劉良佐引了清兵正奔我部而來，現已至荻港附近。」
黃得功大叫了聲「來的正好」，轉向弘光帝道：「皇上且請先歇會兒，待得功擊退敵兵再敘。」
說著，接過隨從遞過來的酒罈，咕咚咕咚一飲而盡，隨手扔到地上，又道：「諸將且隨我去迎敵。」
這是黃得功的習慣，上陣前必要飲酒。只要飲過了酒，黃得功就會意氣風發。此時，雖然大戰左夢庚部時所受的傷尚未痊癒，仍在吊著胳膊，黃得功依然威風凜凜。
劉良佐及其所部，仗著清兵的威勢耀武揚威還行，卻哪裡是黃得功所部的敵手？不一會兒，便已被擒斬過半，縱使尼堪率八旗軍加入作戰，還是被黃得功所部打得連連後退。
劉良佐在多鐸面前夸下了海口，大急，跑到船頭，大聲招降黃得功所部兵將。
黃得功不知此乃劉良佐誘敵之計，大怒，破口大罵。
早已躲於劉良佐背後的張天祿，瞅准了機會，一箭朝黃得功射去，正中黃得功咽喉。
黃得功大吼了一聲，仰面倒地而亡。
清軍藉機反撲，明軍艦船或被撞沉，或被焚毀，士兵落水死者不計其數，在岸上的逃亡者又遭到了清軍騎兵的屠殺，死者萬人。
早有異心的馬得功、田雄趁亂衝上御舟，劫持了弘光帝朱由崧。
總兵翁之琪，奮力相救，沒有成功，又見部下死傷殆盡，不由萬念俱灰投江而死。
黃得功的妻子翁氏聽說丈夫戰死，軍隊慘敗，再無生念，帶二女投了江。
弘光帝朱由崧被劫持後，苦苦哀求馬得功、田雄等放了自己，遭到拒絕後，猛然抱住了田雄，狠狠地咬他的脖子，被人拖開後才算罷了休。
馬得功、田雄等人大怒，把之當作降清的見面禮送給了清軍。
弘光帝朱由崧竟能威武不屈，被殺於菜市口。